企業投入大量資金開發新技術、升級央廚配方或導入新系統，無非希望在提升競爭力的同時，能在辦理營利事業所得稅結算申報時，透過《產業創新條例》第 10 條申請「研究發展支出投資抵減」，為公司省下可觀稅金。然而，許多中小企業與連鎖品牌總部在滿懷期待送出申報後，卻收到國稅局的剔除補稅通知。
問題往往不出在「有沒有做研發」，而是出在「人員薪資認列不符規定」與「日常帳務憑證無法明確區分」。
為什麼研發投抵總是踢鐵板？60 萬節稅額度飛走的真實案例
根據財政部臺北國稅局近期公布的查核案例，甲公司在辦理 113 年度營利事業所得稅結算申報時，列報了《產業創新條例》第 10 條規定的研究發展支出共 2,400 萬元，並依規定於支出金額 15% 限度內，申報抵減當年度應納稅額 360 萬元（2,400 萬元 x 15%）。
但在稅捐稽徵機關進一步調閱並核對甲公司的「研發人員名冊」、「工作內容」及「研發報告」等佐證文件後，發現名冊中夾雜了部分負責行政管理工作的員工。由於這些員工並不屬於「專門從事研究發展工作之全職人員」，國稅局最終依法調減了這批員工的薪資支出共 400 萬元。
【國稅局核定結果試算】
- 原申報抵減稅額：2,400 萬元 x 15% = 360 萬元
- 遭剔除行政管理薪資：400 萬元
- 最終核定抵減稅額：(2,400 萬元 – 400 萬元) x 15% = 300 萬元
- 企業直接損失： 因帳務與人事歸類不清，當年度直接痛失 60 萬元 的合法節稅額度！
產創條例第 10 條「專職研發人員」認定標準與 3 大必備佐證
要避免重蹈甲公司的覆轍，企業主與財務主管必須先釐清《公司或有限合夥事業研究發展支出適用投資抵減辦法》第 5 條的核心規範。國稅局在審認「研究發展人員薪資」時，標準非常明確：
| 人員配置情境 | 是否符合研發投抵認列資格？ | 法規核心認定條件 |
| 配置於「研發單位」之全職研發人員 | 符合 | 必須配置於研究發展活動單位，且專門從事研究發展工作之全職員工。 |
| 未設研發單位，配置於「非研發單位」之全職研發人員 | 有條件符合 | 必須專門從事研究發展活動，且投入研發活動之各項支出可與非研發活動「明確區分」。 |
| 研發單位或其他單位之「行政管理人員」 | 不符合（不得列報） | 凡從事行政、庶務、一般管理工作之人員，其薪資支出均一律不得列為研發投抵範圍。 |
當稅捐稽徵機關進行審認時，企業不能只靠口頭說明，必須完整提示以下 3 大關鍵佐證資料：
- 明確的工作內容說明： 證明該員工具體負責之專案與技術開發範疇，未兼辦一般行政庶務。
- 完整的工作時間紀錄： 詳實記錄人員投入於研發專案的工時佔比與日常紀錄。
- 足資證明專職研發之文件： 如組織圖、研發專案計畫書、實驗或系統開發報告、薪資分攤表與對應之會計傳票憑證。
帳務與憑證混亂，才是企業痛失租稅優惠的隱形殺手
實務上，許多正在快速擴張的中小企業、資訊科技集團，甚至是擁有自營工廠與研發部門的加盟連鎖品牌，明明有實質的研發投入（例如：開發自動化設備、AI 智慧應用或食品加工新製程），卻在稅務申報時敗給了傳統人工記帳：
- 科目與費用混雜： 許多未單獨設置研發部門的中小企業，將研發人員與一般行政人員的薪資、消耗性器材憑證混在同一會計科目入帳，導致查核時無法「明確區分」研發與非研發支出。
- 紙本憑證查找耗時： 傳統人工整理、黏貼紙本憑證，當面臨國稅局要求調閱特定專案憑證時，人工翻找一張紙本憑證平均需耗費 30 分鐘，不僅容易遺失，更常因補件不及而喪失抵減資格。
- 缺乏事前財稅檢核機制： 傳統委外記帳往往只做被動的「事後登打申報」，缺乏專業財稅顧問在日常結轉報表時協助檢視法規合規性。
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參考資料與法令來源：
- 財政部臺北國稅局新聞稿：《非專門從事研發工作全職人員之薪資支出不得列為研究發展支出適用投資抵減之範圍》（更新日期：115-09-15）查看官方原文
- 相關法規：《產業創新條例》第 10 條、《公司或有限合夥事業研究發展支出適用投資抵減辦法》第 5 條。
